Κατά την προμήθεια του πρώτου κεντρικού υπολογιστή από το Πανεπιστήμιο το 1983, η διοίκηση χαρακτήρισε το σύστημα ως «Συγκρότημα Η/Υ» και το καλοκαίρι του ιδίου έτους ορίστηκε τεχνικός και  διοικητικός υπεύθυνος για την οργάνωση και λειτουργία του. Ο όρος αυτός διατηρήθηκε μέχρι το καλοκαίρι το 1986, οπότε με απόφαση του Πρυτανικού Συμβούλιου συστάθηκε η Υπηρεσία Υπολογιστικού Κέντρου σε επίπεδο Τμήματος και καθορίστηκαν οι αρμοδιότητές του.

Επειδή το Υπολογιστικό Κέντρο (Υ/Κ) κλήθηκε να καλύψει πολύπλοκες επιστημονικές και ερευνητικές ανάγκες, η διοίκηση του Πανεπιστημίου είχε ορίσει κατά διαστήματα  επιτροπές οι οποίες λειτούργησαν βοηθητικά προς τις επιλογές και πολιτικές του Υ/Κ.

Τον Οκτώβριο του 1998 δημοσιεύτηκε ο νέος οργανισμός των διοικητικών υπηρεσιών. Με τη εφαρμογή του το φθινόπωρο του 2002 η Υπηρεσία Υπολογιστικού Κέντρου μετετράπη σε Τμήμα Κεντρικού Η/Υ της Διεύθυνσης Μηχανοργάνωσης.

Έκτοτε είναι γνωστό με την ονομασία Υπολογιστικό Κέντρο (Υ/Κ)